Как пишется синии или синие цветы

В данном случае будет правильно синие цветы.

А так все зависит от существительного. В данном словосочетании существительное цветы — во множественном числе.

• Цветы (они какие?) синие — окончание: -ие

Также будет справедливо, для:

• небеса (они какие?) синие
• карандаши (они какие?) синие
• собачки (они какие?) синие
• синие глаза
• синие полоски
• синие тучи
• синие зайцы

А вот если существительное будет в единственном числе и среднем роде, то в этом случае следует использовать окончание -ее, например,

• небо (оно какое?) синее
• синее пальто
• синее море

В случае если имеется в виду глубина, насыщенность цвета, то также используется окончание: -ее, то есть синее чем… например,

• синее чем солнышко,
• синее чем василек.